Экскурс в историю
Школа основана в 1886 году, когда было построено здание, в котором размещалось двухклассное реальное училище для детей железнодорожников.
В 1917 году – получила статус пятилетней железнодорожной школы имени Желябова, где имелось семь классных комнат.
С 1923 года – это семилетняя железнодорожная школа имени Желябова.
С 1925 года школа имела производственный уклон. С этого времени увеличилось число классных комнат.
В 1929 году школа стала называться «Средняя школа имени Желябова».
В 1930 году школе присвоено звание образцовой школы города. Она была укомплектована лучшими учителями-методистами. За примерную постановку учебно-воспитательной работы школа имени Желябова заняла третье место среди образцовых школ РСФСР.
В 1941 году, с началом Великой Отечественной войны, школа имени Короленко была присоединена к школе имени Желябова, где занятия шли в три смены. Во время оккупации здания были разрушены.
1942 год – за сбор денег и облигаций Государственного займа на строительство танка «Победа» учащиеся и работники школы получили благодарственную телеграмму от И.В. Сталина.
В 1946 году восстановлено малое здание школы, занятия шли только в мужских классах. Очень много для восстановления школы сделал педагогический коллектив и А.С. Золотницкий директор школы с 1943 по 1951 год.
В 1954 году восстановлено основное здание школы и произведено смешение мужских и женских классов.
В 1957 году по просьбе учителей и учащихся школа имени Желябова была переименована в среднюю школу
имени Дугинец. Проводилась большая поисковая работа, группы детей выезжали на родину П. Г. Дугинец, в школу приезжали её родственники и делились воспоминаниями.
В 1963 году школа получила название «Средняя железнодорожная политехническая школа имени П.Г. Дугинец».
В 1992 году в порядке эксперимента школа стала государственным экономическим лицеем № 45.
В 1996 году по результатам лицензирования наша школа получила статус Государственного лицея.
1997 год – лицей передан в ведение местных органов управления и стал Муниципальной школой-лицеем № 45.
1999-2002 годы – участие в краевом эксперименте «Развитие личности учащегося через систему правового и гражданского образования и воспитания». Экспериментальная работа признана лучшей в крае, и губернатором был выделен грант.
В 2002 году получила статус муниципального общеобразовательного учреждения «Лицей № 45».
С 2004 года участие во Всероссийском эксперименте по предпрофильному и профильному обучению. В этом же году за высокий уровень образовательно-воспитательной работы и распространение передового педагогического опыта коллектив лицея был награждён дипломом Департамента образования и науки Краснодарского края и цифровой видеокамерой.
2005 год – успешное прохождение аттестации и подтверждение статуса лицея.
2006 год – Управлением образования и науки г. Кропоткина номинирован на участие во Всероссийском конкурсе "Лучшие школы Росии", где стал однимм из победетелей от Краснодарского края и получил президентский грант в 1 млн. рублей.
С 2007 года лицей является экспериментальной площадкой ЗАО «Новый диск» (г.Москва) по апробации программного обеспечения, используемого в рамках образования школьников в России и ближнем зарубежье.
В 2008 году школам-миллионерам было разрешено повторное участие в конкурсе, "Лучшие школы России" с целью выявления эффективности использования выделенных ранее средств и актуальности поставленных задач на будущее. Мы рискнули, решив доказать, что первый миллион был не случаен и что «порох в пороховницах» в 45-ом лицее еще есть. В итоге, в копилке лицея и второй, заработанный президентский миллион! Дважды "Лучшая школа России" - это звучит гордо, но и ко многому обязывает...
С 1 сентября 2008 года в лицее введена единая школьная форма для учащихся всех классов с градацией по возрастам - 1-4, 5-8 и 9-11 классы. Оригинальные темно-синие сарафаны наших девочек стали не только эталоном школьного стиля в городе, но и настоящей "фишкой" лицея.
В 2009 году МОУ лицей № 45 внесен в Федеральный Реестр "Всероссийская Книга Почета" (свидетельство № 0002840).
По итогам Единого Государственного Экзамена (ЕГЭ) 2009-2010 учебного года лицей № 45 входит в ДЕСЯТКУ ЛУЧШИХ лицеев и гимназий Краснодарского края.
Накануне 1 сентября 2011 года лицей № 45 стал одним из победителей краевого конкурса и вошел в число 51 Базовой школы края. Коллектив лицея получил право на ведение дистанционного обучения детей-инвалидов, учащихся из малокомплектных сельских школ и одаренных детей района. Кроме того, руководством
департамента образования и науки Краснодарского края директор нашего лицея Елена Юрьевна в конкурентной борьбе была избрана "ЛИЦОМ" Базовых школ края и выступила с докладом на краевой педагогической конференции, проводимой губернатором Александром Николаевичем Ткачевым. (презентация к докладу) Следует отметить, что в истории системы образования г.Кропоткина и Кавказского района впервые данной честью был удостоен представитель нашего города и района, а тем более, директор школы.
В декабре 2011 года департамент образования и науки подвел итоги конкурса на лучшее общеобразовательное 
учреждение, добивашиеся высоких результатов в обучении школьников в 2010-2011 учебном гоуд. В нем приняли участие 600 лучших школ из всех районов нашего края, но только 120 из них стали победителями, в числе которых и лицей №45 г.Кропоткина. В общем рейтенге школ-победителей наш лицей занял почетное второе место, а его учительский коллектив получил грант губернатора Краснодарского края А.Н. Ткачева в размере 366 тысяч рублей. Рейтинг...
В ноябре 2013 года лицей № 45 принимал участие во Всероссийском конкурсе "100 лучших школ России", организованном при участии и поддержке Комитета по образованию Госудврственной Думы РФ, Совета Федерации, Союза директоров ссузов России, Международной академии качества и маркетинга, где стал лауреатом в номинации "Лучший лицей", а директор лицея Елена Юрьевна была отмечена Почетным знаком "Директор года-2013". Торжественное награждение лауреатов конкурса состоялось в г.Санкт-Петербурге 29 ноября в рамках Всероссийского образовательного форума "Школа будущего: проблемы и перспективы развития современной школы России".
В 2015 году лицей вошел в перечень 100 лучших образовательных организаций Краснодарского края (ТОП-100), обеспечивающих высокий уровень подготовки выпускников. В качестве награды коллектив лицея получил губернаторский грант в размере миллиона рублей, который направлен как на реализацию образовательных программ, новое оборудование и поддержку лучших педагогов.
До 2020 года (до пандемии) лицей ежегодно входил в различные региональные рейтинги лучших образовательных организаций Краснодарского края.
В разные годы 45-ой руководили:
